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• label : denoptim.fragmenter.ScaffoldingPolicy, denoptim.graph.FragIsomorphEdge, denoptim.graph.FragIsomorphNode, denoptim.gui.GraphViewerPanel.JVertex
• labTitle : denoptim.gui.VertexViewPanel
• labTyp : denoptim.gui.GUIGraphHandler.showHideLabelsListener
• LARGEST_FRAGMENT : denoptim.fragmenter.ScaffoldingPolicy
• lastCutRulesFile : denoptim.gui.GUIPreferences
• lastIteration : denoptim.gui.GUIGraphHandler.showHideLabelsListener
• lastUsedCutRulFile : denoptim.gui.CuttingRulesSelectionDialog
• layers : denoptim.utils.AtomOrganizer
• layout : denoptim.gui.GraphViewerPanel
• lblAddH : denoptim.gui.GAParametersForm
• lblAPC2BO : denoptim.gui.GUIAPClassDefinitionDialog
• lblAPCName : denoptim.gui.GUIAPClassDefinitionDialog
• lblChartPointSize : denoptim.gui.GUIPreferencesDialog
• lblCPMat : denoptim.gui.FSParametersForm
• lblCustomvars : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lblDDValueClasses : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lblDDValueDefinition : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lblDDValueDescripton : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lblDDValueName : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lblDDValueParams : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lblDDValueSource : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lblDDValueTitle : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lblEq : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lblFitProviderInterpreter : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lblFitProviderSource : denoptim.gui.FitnessParametersForm
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• lblFSESource : denoptim.gui.FSEParametersForm
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• lblGraphNodeSize : denoptim.gui.GUIPreferencesDialog
• lblGraphTxtSize : denoptim.gui.GUIPreferencesDialog
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• lblPar1 : denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• lblPar10 : denoptim.gui.GAParametersForm
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• lblPar8 : denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• lblPar9 : denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• lblParCrowd1 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lblParCrowd2 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lblParCrowd3 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lblParCrowd4 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lblParMolSz1 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lblParMolSz2 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lblParMolSz3 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lblParMolSz4 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lblParMSM : denoptim.gui.GAParametersForm
• lblParWC : denoptim.gui.GAParametersForm
• lblPropTags : denoptim.gui.GUIPreferencesDialog
• lblRingSysTmpl : denoptim.gui.GAParametersForm
• lblScaffoldingPolicy : denoptim.gui.MolToGraphParametersDialog
• lblSMILESTo3D : denoptim.gui.GUIPreferencesDialog
• lblTemplateContract : denoptim.gui.MolToGraphParametersDialog
• lblTmpSpace : denoptim.gui.GUIPreferencesDialog
• lblTotItems : denoptim.gui.GUIInspectFSERun, denoptim.gui.GUIInspectGARun
• leftPane : denoptim.gui.GraphVertexMolViewerPanel
• lengthInAtoms : denoptim.fragmenter.BridgeHeadFindingRule
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• levelProbData : denoptim.gui.GAParametersForm
• libCCxTPIdx : denoptim.graph.rings.RingClosuresArchive
• lidx : denoptim.utils.AtomOrganizer
• line3dTrees : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lineAddH : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineAPsBtns : denoptim.gui.GUIEmptyVertexMaker
• linearAngleLimit : denoptim.programs.fragmenter.FragmenterParameters
• linearityLimit : denoptim.graph.rings.RingClosureParameters
• lineBBType : denoptim.gui.GUIEmptyVertexMaker
• lineCPMat : denoptim.gui.FSParametersForm
• lineCustomVars : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lineEmbTmpl : denoptim.gui.MolToGraphParametersDialog
• lineEq : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lineFitProviderInterpreter : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lineFitProviderSource : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lineFPSource : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lineFrgMols : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineFSESource : denoptim.gui.FSEParametersForm
• lineFSSource : denoptim.gui.FSParametersForm
• lineGASource : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineGrowthPropMode : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineIntOrExt : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• lineMolToGraph : denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar1 : denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar10 : denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar11 : denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar12 : denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar13 : denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar14 : denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar15 : denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar16 : denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar17 : denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar18 : denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar19 : denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar2 : denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar20 : denoptim.gui.GAParametersForm
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• linePar22 : denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
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• linePar24 : denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar25 : denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
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• linePar28 : denoptim.gui.FSParametersForm
• linePar3 : denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar30 : denoptim.gui.FSParametersForm
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• linePar33 : denoptim.gui.FSParametersForm
• linePar34 : denoptim.gui.FSParametersForm
• linePar4 : denoptim.gui.FSEParametersForm
• linePar5 : denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar5a : denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar6 : denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar7 : denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar8 : denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• linePar9 : denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• lineParCrowd1 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineParCrowd2 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineParCrowd3 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineParCrowd4 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineParMolSz1 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineParMolSz2 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineParMolSz3 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineParMolSz4 : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineParMSM : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineParWC : denoptim.gui.GAParametersForm
• linePreFitnessUIDCheck : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• linePropTags : denoptim.gui.GUIPreferencesDialog
• lineRCV : denoptim.gui.GUIEmptyVertexMaker
• lineRingSysTmpl : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineRingTmplsFrags : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineRingTmplsScaff : denoptim.gui.GAParametersForm
• lineScaffoldingPolicy : denoptim.gui.MolToGraphParametersDialog
• lineSrcOrNew : denoptim.gui.FitnessParametersForm, denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• lineTemplateContract : denoptim.gui.MolToGraphParametersDialog
• LINKAPS : denoptim.constants.DENOPTIMConstants
• links : denoptim.graph.rings.ClosableChain
• listIterator : denoptim.io.IteratingAtomContainerReader
• listPanel : denoptim.gui.GUIGraphHandler.ConfigTemplateDialog
• loadedGraph : denoptim.gui.GraphViewerPanel
• loadFSToolTip : denoptim.gui.GUIGraphHandler
• localBlock1 : denoptim.gui.FitnessParametersForm, denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• localBlock2 : denoptim.gui.FitnessParametersForm, denoptim.gui.FSEParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm, denoptim.gui.GAParametersForm
• localBlock3 : denoptim.gui.FitnessParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm
• localBlock4 : denoptim.gui.FitnessParametersForm, denoptim.gui.FSParametersForm
• localBlock5 : denoptim.gui.FSParametersForm
• localBlockCrowd3 : denoptim.gui.GAParametersForm
• localBlockCrowd4 : denoptim.gui.GAParametersForm
• localBlockCrowdGraph : denoptim.gui.GAParametersForm
• localBlockLvlProb3 : denoptim.gui.GAParametersForm
• localBlockLvlProb4 : denoptim.gui.GAParametersForm
• localBlockLvlProbAll : denoptim.gui.GAParametersForm
• localBlockLvlProbGraph : denoptim.gui.GAParametersForm
• localBlockMolSz3 : denoptim.gui.GAParametersForm
• localBlockMolSz4 : denoptim.gui.GAParametersForm
• localBlockMolSzAll : denoptim.gui.GAParametersForm
• localBlockMolSzGraph : denoptim.gui.GAParametersForm
• localMsg : denoptim.graph.DGraph
• LOCK : denoptim.fragspace.FragmentSpace, denoptim.task.StaticTaskManager
• lock : denoptim.task.Task
• lockInitialPositions : denoptim.gui.DNPSpringLayout< V, E >
• logFile : denoptim.programs.RunTimeParameters
• logFilePathname : denoptim.fragmenter.ConformerExtractorTask, denoptim.fragmenter.FragmenterTask
• logger : denoptim.fitness.FitnessProvider, denoptim.fitness.FitnessProviderTest, denoptim.fragmenter.ConformerExtractorTask, denoptim.fragmenter.FragmentClusterer, denoptim.fragmenter.FragmenterTask, denoptim.ga.EvolutionaryAlgorithm, denoptim.ga.ExternalCmdsListener, denoptim.graph.rings.CyclicGraphHandler, denoptim.graph.rings.RingSizeManager, denoptim.logging.Monitor, denoptim.molecularmodeling.ChemicalObjectModel, denoptim.molecularmodeling.MultiMolecularModelBuilder, denoptim.molecularmodeling.RingClosureTool, denoptim.molecularmodeling.ThreeDimTreeBuilder, denoptim.programs.genetweeker.GeneOpsRunner, denoptim.programs.RunTimeParameters, denoptim.task.ParallelAsynchronousTaskExecutor, denoptim.utils.DummyAtomHandler
• loggerIdentifier : denoptim.task.ProgramTask
• lstAPs : denoptim.graph.EmptyVertex, denoptim.graph.Fragment
• lstAtoms : denoptim.integration.tinker.TinkerMolecule
• lstConfs : denoptim.graph.rings.RingClosingConformations
• lstFragmentClass : denoptim.ga.EAUtils
• lstSymAPs : denoptim.graph.EmptyVertex, denoptim.graph.Fragment
• lstVert : denoptim.graph.rings.RingSizeManager
• lvlGrowthMultiplier : denoptim.programs.denovo.GAParameters
• lvlGrowthProbabilityScheme : denoptim.programs.denovo.GAParameters
• lvlGrowthSigmaMiddle : denoptim.programs.denovo.GAParameters
• lvlGrowthSigmaSteepness : denoptim.programs.denovo.GAParameters