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• handlePopup() : denoptim.gui.GraphViewerPanel.PopupGraphMousePlugin
• handleThrowable() : denoptim.programs.combinatorial.FragSpaceExplorer, denoptim.programs.denovo.GARunner, denoptim.programs.fitnessevaluator.FitnessRunner, denoptim.programs.fragmenter.Fragmenter, denoptim.task.ProgramTask
• hasActive() : denoptim.task.StaticTaskManager
• hasCDKAnalogue() : denoptim.graph.Edge.BondType
• hasClosableRotamer() : denoptim.graph.rings.RingClosureFinder
• hasConnectedSrcAtom() : denoptim.graph.AttachmentPoint
• hasFitness() : denoptim.graph.Candidate, denoptim.graph.CandidateLW
• hasForbiddenEnd() : denoptim.graph.DGraph
• hasFreeAP() : denoptim.graph.EmptyVertex, denoptim.graph.Vertex
• hashCode() : denoptim.graph.SymmetricSetWithMode, denoptim.utils.ObjectPair
• hasInterdependentPaths() : denoptim.graph.rings.CyclicGraphHandler
• hasIsomorph() : denoptim.fragspace.FragmentSpace
• hasMolecularRepresentation() : denoptim.graph.rings.PathSubGraph
• hasNext() : denoptim.fragspace.FragsCombinationIterator, denoptim.graph.rings.RandomCombOfRingsIterator, denoptim.io.IteratingAtomContainerReader
• hasOptions() : denoptim.programs.fragmenter.CuttingRule
• hasOrEmbedsRings() : denoptim.graph.DGraph
• hasProblems() : denoptim.utils.ManySMARTSQuery
• hasProperty() : denoptim.graph.Vertex
• hasRings() : denoptim.graph.DGraph
• hasSameSrcAtom() : denoptim.graph.AttachmentPoint
• hasScaffoldTypeVertex() : denoptim.graph.DGraph
• hasSelected() : denoptim.gui.GraphViewerPanel
• hasSelectedNodes() : denoptim.gui.GraphVertexMolViewerPanel
• hasSymmetricAP() : denoptim.graph.DGraph, denoptim.graph.EmptyVertex, denoptim.graph.Vertex
• hasSymmetricSubClass() : denoptim.programs.fragmenter.MatchedBond
• hasSymmetryConstrain() : denoptim.fragspace.FragmentSpace
• hasSymmetryInvolvingVertex() : denoptim.graph.DGraph
• hasUnsavedAPEdits() : denoptim.gui.FragmentViewPanel, denoptim.gui.VertexAsGraphViewPanel, denoptim.gui.VertexAsTwoDimStructureViewPanel, denoptim.gui.VertexViewPanel
• hasUnsavedChanges() : denoptim.gui.GUICardPanel, denoptim.gui.GUICompatibilityMatrixTab, denoptim.gui.GUIGraphHandler, denoptim.gui.GUIMainPanel, denoptim.gui.GUIPrepare, denoptim.gui.GUIVertexInspector, denoptim.gui.IParametersForm, denoptim.gui.ParametersForm
• HomePanel() : denoptim.gui.HomePanel