- u -

• UndetectedFileFormatException() : denoptim.files.UndetectedFileFormatException
• UndirectedEdge() : denoptim.graph.simplified.UndirectedEdge
• unionOfIntersectingSets() : denoptim.utils.GeneralUtils
• updateAPClassCompatibilitiesList() : denoptim.gui.CompatibilityMatrixForm
• updateAPs() : denoptim.graph.Fragment
• updateAPsInJmolViewer() : denoptim.gui.FragmentViewPanel
• updateAPsMapAndTable() : denoptim.gui.FragmentViewPanel, denoptim.gui.VertexAsGraphViewPanel, denoptim.gui.VertexAsTwoDimStructureViewPanel
• updateBBTypeBasedOnAPCount() : denoptim.gui.GUIEmptyVertexMaker
• updateCappingRulesTable() : denoptim.gui.CompatibilityMatrixForm
• updateCrowdProbDataset() : denoptim.gui.GAParametersForm
• updateForbiddenEndsTable() : denoptim.gui.CompatibilityMatrixForm
• updateGraphListSpinner() : denoptim.gui.GUIGraphHandler
• updateInnerApID() : denoptim.graph.Template
• updateInnerToOuter() : denoptim.graph.Template
• updateMolevularViewer() : denoptim.gui.GraphVertexMolViewerPanel
• updatemolSizeProbDataset() : denoptim.gui.GAParametersForm
• updateMutTypeToFixedSTructure() : denoptim.graph.Template
• updateOpenRecentMenu() : denoptim.gui.MainToolBar
• updateSubsProbDataset() : denoptim.gui.GAParametersForm
• updateSymmetryRelations() : denoptim.graph.Fragment
• updateVrtxListSpinner() : denoptim.gui.GUIVertexInspector, denoptim.gui.GUIVertexSelector
• updateXYZFromINT() : denoptim.molecularmodeling.ChemicalObjectModel
• useAPclassBasedApproach() : denoptim.fragspace.FragmentSpace
• useExternalFitness() : denoptim.fitness.FitnessParameters
• useGivenRoots() : denoptim.programs.combinatorial.CEBLParameters
• useLevelBasedProb() : denoptim.programs.denovo.GAParameters
• useMolSizeBasedProb() : denoptim.programs.denovo.GAParameters
• usesProperTorsion() : denoptim.integration.tinker.TinkerAtom