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• i : denoptim.graph.Vertex.BBType
• iac : denoptim.graph.Candidate
• iacPathVAVB : denoptim.graph.rings.PathSubGraph
• id : denoptim.graph.AttachmentPoint, denoptim.gui.GraphViewerPanel.JEdge, denoptim.task.ProcessHandler, denoptim.task.Task
• idAPOnIncomingGraph : denoptim.utils.GraphEdit
• idNewAP : denoptim.programs.genetweeker.GeneOpsRunnerParameters
• idNewVrt : denoptim.programs.genetweeker.GeneOpsRunnerParameters
• idStr : denoptim.gui.GraphViewerPanel.JVertex
• idTargetAP : denoptim.programs.genetweeker.GeneOpsRunnerParameters
• idx : denoptim.graph.rings.ChainLink
• ignorableFragments : denoptim.programs.fragmenter.FragmenterParameters
• ignorableFragmentsFile : denoptim.programs.fragmenter.FragmenterParameters
• imgFile : denoptim.graph.Candidate
• implementation : denoptim.fitness.DescriptorForFitness, denoptim.programs.RunTimeParameters.ParametersType
• INCHIKEYTAG : denoptim.constants.DENOPTIMConstants
• incomingAPMap : denoptim.utils.GraphEdit
• incomingBBId : denoptim.utils.GraphEdit
• incomingBBTyp : denoptim.utils.GraphEdit
• incomingEdgeQuery : denoptim.graph.VertexQuery
• incomingGraph : denoptim.utils.GraphEdit
• incompatChains : denoptim.ga.GraphOperations.FragForClosabChains
• inEnabled : denoptim.gui.GUIGraphHandler.GraphSpinnerChangeEvent, denoptim.gui.GUIVertexInspector.VrtxSpinnerChangeEvent, denoptim.gui.GUIVertexSelector.VrtxSpinnerChangeEvent
• inFile : denoptim.programs.mol2graph.Mol2GraphParameters
• inGraphs : denoptim.programs.grapheditor.GraphEdParameters
• inGraphsA : denoptim.programs.graphlisthandler.GraphListsHandlerParameters
• inGraphsB : denoptim.programs.graphlisthandler.GraphListsHandlerParameters
• inGraphsFile : denoptim.programs.grapheditor.GraphEdParameters
• inGraphsFileA : denoptim.programs.graphlisthandler.GraphListsHandlerParameters
• inGraphsFileB : denoptim.programs.graphlisthandler.GraphListsHandlerParameters
• initialTransform : denoptim.gui.VertexAsTwoDimStructureViewPanel.TwoDimStructurePanel
• initMolsToFragmentFile : denoptim.programs.denovo.GAParameters
• initPoplnFile : denoptim.programs.denovo.GAParameters
• inMols : denoptim.programs.grapheditor.GraphEdParameters, denoptim.programs.mol2graph.Mol2GraphParameters
• innerGraph : denoptim.graph.Template
• innerToOuterAPs : denoptim.graph.Template
• inpFile : denoptim.programs.fitnessevaluator.FRParameters
• inpFileF : denoptim.programs.genetweeker.GeneOpsRunnerParameters
• inpFileGraphA : denoptim.programs.isomorphism.IsomorphismParameters
• inpFileGraphB : denoptim.programs.isomorphism.IsomorphismParameters
• inpFileM : denoptim.programs.genetweeker.GeneOpsRunnerParameters
• inpSDFFile : denoptim.programs.moldecularmodelbuilder.MMBuilderParameters
• inputFile : denoptim.fragmenter.FragmenterTask
• inputIsOK : denoptim.gui.GUIPreferencesDialog
• instance : denoptim.json.DENOPTIMgson, denoptim.main.CLIOptions, denoptim.task.StaticTaskManager
• intendedStop : denoptim.ga.ExternalCmdsListener
• interfaceDir : denoptim.programs.denovo.GAParameters
• interpreterExternalExe : denoptim.fitness.FitnessParameters
• invariant : denoptim.graph.simplified.Node, denoptim.graph.simplified.UndirectedEdge
• INVPI : denoptim.constants.DENOPTIMConstants
• is : denoptim.task.StreamGobbler
• isActive : denoptim.gui.FragmentViewPanel.PausableTableModelListener, denoptim.gui.VertexAsGraphViewPanel.PausableTableModelListener, denoptim.gui.VertexAsTwoDimStructureViewPanel.PausableTableModelListener
• isAsync : denoptim.ga.EvolutionaryAlgorithm
• isAtm : denoptim.graph.FragIsomorphNode
• isBond : denoptim.graph.FragIsomorphEdge
• isCLIEnabled : denoptim.main.Main.RunType
• isDu : denoptim.utils.ConnectedLigand
• isFolder : denoptim.files.FileFormat
• isMaster : denoptim.programs.RunTimeParameters
• ISO_PARAMS : denoptim.programs.RunTimeParameters.ParametersType
• isoFamMembersFile : denoptim.fragmenter.ConformerExtractorTask
• ISOMORPHICFAMILYID : denoptim.constants.DENOPTIMConstants
• isomorphicFamilyId : denoptim.fragmenter.ConformerExtractorTask
• isomorphicSampleSize : denoptim.programs.fragmenter.FragmenterParameters
• isomorphsCount : denoptim.programs.fragmenter.FragmenterParameters
• isRCV : denoptim.graph.Vertex
• isSelected : denoptim.gui.CompatibilityMatrixForm.CompatibilityRuleLine
• isStandaloneFragmentClustering : denoptim.programs.fragmenter.FragmenterParameters
• isSymm : denoptim.programs.fragmenter.MatchedBond
• isValid : denoptim.fragspace.FragmentSpace
• item : denoptim.gui.MoleculeViewPanel
• itemsWithFitness : denoptim.gui.GUIInspectFSERun
• iteration : denoptim.gui.DNPSpringLayout< V, E >
• itn : denoptim.molecularmodeling.RingClosureTool