- f -

• FileAndFormat() : denoptim.files.FileAndFormat
• fillDataTable() : denoptim.gui.MoleculeViewPanel
• fillTopologicalMatrix() : denoptim.graph.rings.RingSizeManager
• filterFragment() : denoptim.fragmenter.FragmenterTools
• filterStrucutresBySMARTS() : denoptim.fragmenter.FragmenterTools
• findAllCDKDescriptors() : denoptim.fitness.DescriptorUtils
• findAllDENOPTIMDescriptors() : denoptim.fitness.DescriptorUtils
• findAllDescriptorImplementations() : denoptim.fitness.DescriptorUtils
• findAllMappings() : denoptim.fragspace.APMapFinder
• findAtomPath() : denoptim.graph.rings.PathSubGraph
• findAttractors() : denoptim.molecularmodeling.ChemicalObjectModel, denoptim.utils.RingClosingUtils
• findDescriptorImplementations() : denoptim.fitness.DescriptorUtils
• findMappingCompatibileAPs() : denoptim.fragspace.APMapFinder
• findPath() : denoptim.graph.rings.PathSubGraph
• findVertices() : denoptim.graph.DGraph
• findVerticesIds() : denoptim.graph.DGraph
• fireMouseModePropertyChange() : denoptim.gui.GraphViewerPanel
• FitnessEvaluationTask() : denoptim.programs.fitnessevaluator.FitnessEvaluationTask
• FitnessExpressionParser() : denoptim.fitness.FitnessExpressionParser
• FitnessParameters() : denoptim.fitness.FitnessParameters
• FitnessParametersForm() : denoptim.gui.FitnessParametersForm
• FitnessProvider() : denoptim.fitness.FitnessProvider
• FitnessRunner() : denoptim.programs.fitnessevaluator.FitnessRunner
• FitnessTask() : denoptim.task.FitnessTask
• fixEdgeDirections() : denoptim.graph.DGraph
• fixLongeLinesInXYZ() : denoptim.integration.tinker.ConformationalSearchPSSROT
• flipEdge() : denoptim.graph.Edge
• format() : denoptim.logging.HTMLLogFormatter
• foundAlternativeLink() : denoptim.fragspace.GraphLinkFinder
• foundException() : denoptim.task.Task
• foundForbiddenEnd() : denoptim.ga.EAUtils
• foundMapping() : denoptim.fragspace.APMapFinder
• FPRunner() : denoptim.programs.fitnessevaluator.FPRunner
• FragForClosabChains() : denoptim.ga.GraphOperations.FragForClosabChains
• FragIsomorphEdge() : denoptim.graph.FragIsomorphEdge
• FragIsomorphNode() : denoptim.graph.FragIsomorphNode
• Fragment() : denoptim.graph.Fragment
• FragmentAlignement() : denoptim.fragmenter.FragmentAlignement
• fragmentation() : denoptim.fragmenter.FragmenterTools
• FragmentClusterer() : denoptim.fragmenter.FragmentClusterer
• Fragmenter() : denoptim.programs.fragmenter.Fragmenter
• FragmenterParameters() : denoptim.programs.fragmenter.FragmenterParameters
• FragmenterTask() : denoptim.fragmenter.FragmenterTask
• FragmentIsomorphismInspector() : denoptim.graph.FragmentIsomorphismInspector
• FragmentSpace() : denoptim.fragspace.FragmentSpace
• FragmentSpaceParameters() : denoptim.fragspace.FragmentSpaceParameters
• FragmentViewPanel() : denoptim.gui.FragmentViewPanel
• FragsCombination() : denoptim.fragspace.FragsCombination
• FragsCombinationIterator() : denoptim.fragspace.FragsCombinationIterator
• FragSpaceExplorer() : denoptim.programs.combinatorial.FragSpaceExplorer
• freezeTemplate() : denoptim.graph.Template
• fromAtomContainerNoGraph() : denoptim.graph.Candidate
• fromJson() : denoptim.graph.DGraph, denoptim.graph.EmptyVertex, denoptim.graph.Fragment, denoptim.graph.Template, denoptim.graph.Vertex
• fromString() : denoptim.files.FileFormat
• FRParameters() : denoptim.programs.fitnessevaluator.FRParameters
• FSEParametersForm() : denoptim.gui.FSEParametersForm
• FSParametersForm() : denoptim.gui.FSParametersForm
• FSParamsDialog() : denoptim.gui.FSParamsDialog